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RIBO-CANCER - Evaluation clinique des ARN comme bio-marqueurs et cible thérapeutique

Publié le 07-10-2009

Coordinateurs : Stéphan Vagner et Jérôme Cavaillé
Projet financé en 2008-2010
Expression de microRNA dans des cancers métastatiques du sein évaluée par « microarrays » sur oligonucléotides modifiés (LNA)
 

Contexte

L’implication des petits ARN dans la modulation de l’expression génique est l’une des découvertes majeures de ces dernières années.
Parmi les différentes familles de petits ARN, les micro(mi)RNAs forment une classe de molécules d’ARN d’environ 22 nucléotides, présentes chez de nombreux eucaryotes et impliquées dans de nombreux processus physiologiques ou pathologiques, en régulant l’expression des gènes par dégradation des ARNm ou inhibition traductionnelle.
 

Objectif

Ce programme étudie le rôle général de l’ARN (ARN non codant, épissage, protéines de liaison à l’ARN) comme bio-marqueur et cible thérapeutique dans les tumeurs gastriques, les cancers du sein et les leucémies, en étroite collaboration avec des cliniciens et des biologistes.
Un volet de ce programme concerne également le mode d’action moléculaire et la fonction biologique des microARN à travers l’étude de souris KO.
Le projet vise à l’obtention de données d’expression de miRNA dans différents modèles. L’expression des miRNAs est étudiée grâce à des puces obtenues par un accord avec le Laboratoire Européen de Biologie Moléculaire (EMBL, GeneCore facility, Heidelberg). Les puces seront constituées à l’EMBL à partir des oligonucléotides commerciaux Exiqon. L’hybridation des ARNs des échantillons sur les puces et le traitement des données seront réalisés sur la plateforme Biopuces (Génopole de Toulouse).
Le projet doit permettre la réalisation des puces (constitution des puces à l’EMBL et traitement des ARNs fournis par les équipes à la plateforme « Biopuces ») depuis leur vérification jusqu’à l’analyse des données brutes d’hybridation en passant par leur marquage, hybridation et scan, à Toulouse.
 

Mots clés

miRNA, modèles murins
 

Publications

Widespread Estrogen-Dependent Repression of microRNAs Involved in Breast Tumor Cell Growth.
Gérard Maillot, Magali Lacroix-Triki, Sandra Pierredon, Lise Gratadou, Sabine Schmidt, Vladimir Bénès, Henri Roché, Florence Dalenc, Didier Auboeuf, Stefania Millevoi, and Stéphan Vagner
Cancer Res 2009, Nov 1 ; 69 : (21) 8332-40
 

Financement accordé

  • Contrat d’assistant-ingénieur (18 mois) - Sophie Polès (réalisation de puces et analyse des données)
  • Missions vers l’EMBL
  • Mini-symposium sur le thème « miRNA et Cancer » à Toulouse.
     

Liste des équipes participant au projet

  • S. Vagner  : Inserm U563 - CPTP, ICR
  • J. Cavaillé : CNRS UMR 5099 - LBME, UPS
  • L. Buscail  : Inserm U858 – I2MR, CHU Rangueil, Institut Louis Bugnard
  • G. Delsol / P Brousset  : Inserm U563 - CPTP, CHU Purpan
  • G. Favre : Inserm U563 - CPTP, ICR
  • H. Prats  : Inserm U858 – I2MR, CHU Rangueil, Institut Louis Bugnard
  • AC Prats : Inserm U858 – I2MR, CHU Rangueil, Institut Louis Bugnard
  • V Le Berre : Plateforme Biopuces, Génopole de Toulouse Midi-Pyrénées
    INSA/DGBA, Toulouse.
     
 


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